继续教育学院是学校承担社会服务职能的重要窗口，是构建终身教育体系和学习型社会的重要阵地。学院起始于1988年开设的中医药高等教育自学考试辅导班，1998年开始中医药高等学历继续教育，2000年更名为成人教育学院，2011年更名为继续教育学院。

2009年4月被山西省卫生厅授予“省级中医药继续教育基地”，2010年6月被国家中医药管理局确定为“国家中医药管理局中医药优势学科继续教育基地”“国家中医药管理局城市社区中医药知识与技能培训示范基地”“国家中医药管理局农村中医药知识与技能培训示范基地”，2013年被山西省人力资源和社会保障厅评为“省级专业技术人员继续教育基地”。2017年成立了全国中医药高等教育院校首家“中医师承教育中心”。2019年国家中医药管理局确定为“中医药高层次人才培养基地建设单位”。2021年获批“山西省职业技能等级认定机构”。2024年获批“执（从）业药师继续教育机构”。

学院高等学历继续教育现开设中医学、针灸推拿学、中药学、中西医临床医学、护理学5个专业，均为专升本层次，办学近30年来，为全省各级医疗机构培养了中医药人才50000余名。

学院非学历继续教育（社会培训）主要承担国家、省卫健委、省人社厅及相关地市、单位的委托培训任务，以及组织开展中医师承教育和“西学中”培训项目，主要有全国西学中骨干人才、中医类别全科医师、山西省优秀中医临床人才、中医药适宜技术推广和基层医疗机构中医药服务学历能力双提升等项目。20年来，学院面向省内外开展了多层次、多规格、多元化的培训，为社会培养优秀临床及管理人才30000余名。

学院于2021年获批为山西省职业技能等级认定机构，可面向社会开展9个工种职业技能等级认定工作，其中包括医药商品购销员、保健调理师、保健按摩师、公共营养师、中药炮制工、药物制剂工、生殖健康咨询师等。

继续教育学院始终坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，以服务国家战略和区域社会需求为牵引，以学历能力双提升为主线，以深化继续教育培养模式为动力，构建连贯式终身学习体系，培养下得去、够得着、留得住的实用型中医药人才，努力将学院建成山西中医药优质教育资源的展示区、培训教育教学改革的试验田和继续教育行业培训的主阵地。